四环素类、红霉素酯化物、磺胺药、抗结核药（利福平、异烟肼等）氯霉素、林可霉素类、两性霉素B等均可引起肝脏损害，临床表现为胆汁淤积，肝细胞变性，坏死谷丙转氨酶升高等，因此在肝功能不全时，这些药物应慎用，或尽量避免使用。
对肾脏有毒性的抗生素主要有四类：1）多肽类抗生素：包括多粘菌素B、多粘菌素E（粘菌素）、杆菌肽等。
2）氨基糖甙类抗生素：链霉素、庆大霉素、新霉素、卡那霉素、丁胺卡那、妥布霉素等都对肾脏有一定毒性，主要损害近曲小管上皮细胞，一般不影响肾小球，临床引起蛋白尿、管型尿、红细胞直至肾功能减退。
3）四环素类：土霉素、四环素均可使血中非蛋白氮升高，引起氮质血症、恶心等。
4）抗真菌抗生素：如两性霉素B
这些抗生素对肾脏的损害均在肾小管，有肾功不全的病人要慎用，若发现问题在用药后3~6天立即停药，绝大多数能恢复正常。
