【相同点】二方均用黄芩、半夏清胆和胃；治疗邪在半表半里的胆胃不和证。

【不同点】

小柴胡汤：配柴胡疏肝利胆、透邪外出，人参、大枣、炙甘草益气健脾，生姜助半夏和胃止呕；功用和解少阳；主治少阳证；以往来寒热、胸胁苦满、口苦咽干、目眩脉弦为辨证要点。

蒿芩清胆汤：配青蒿清透少阳邪热，竹茹、陈皮、枳壳泻热化痰、宽胸理气，青黛、滑石、茯苓、甘草清热利湿，使湿热从小便而去；功用清胆利湿、和胃化痰；主治少阳湿热痰浊证；以寒热如疟、寒轻热重、口苦胸闷、舌红苔黄腻、脉滑数为辨证要点。

【比较要点】二方均治邪在半表半里的胆胃不和证。但小柴胡汤为单纯的少阳证；蒿芩清胆汤为少阳兼夹湿热痰浊证。